Мутагене́з — працэс узнікнення мутацый пад уздзеяннем фактараў (мутагенаў) навакольнага і ўнутранага асяроддзя.
Аснова мутагенеза — змены ў малекулах нуклеінавых кіслот, што захоўваюць і перадаюць спадчынную інфармацыю, і парушэнні мітатычнага апарата клетачнага дзялення.
Адрозніваюць натуральны (спантаны) і штучны (індуцыраваны) мутагенез.