Ваенна-медыцынскі інстытут БДМУ — структурнае падраздзяленне Беларускага дзяржаўнага медыцынскага ўніверсітэта.
У 1995 годзе сумесным загадам Міністра абароны і Міністра аховы здароўя Рэспублікі Беларусь па ўзгадненні з Міністрам адукацыі Рэспублікі Беларусь быў утвораны ваенна-медыцынскі факультэт ва ўстанове адукацыі «Беларускі дзяржаўны медыцынскі ўніверсітэт».
З 7 чэрвеня 2021 года ваенна-медыцынскі факультэт атрымаў статус інстытута.